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广州健仑生物科技有限公司
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对于样品的保存,低温冻存保护可能有助于样品的保存。在比较储存样品和新鲜样品中的微生物组成之前,可以采用一种快速的方法,来评估保护剂的作用,那就是检测一下样品DNA的量,如果DNA量不足,那么你采用的方法也许并不适用于这种微生物的保存。
RNAlater最初是作为一种RNA保存剂,由Qiagen和Thermo Fisher等厂家开发出来的,现在也可以用于保存DNA。
RNAlater是特殊的样品储存液,只要在采样后立即将新鲜样品浸入这种液体试剂,RNlater可以迅速渗透到组织或其他生物样本中,稳定并保护RNA完整而不被降解,确保下游分析得到的数据真实反应样品的表达信息。
人类微生物组计划(Human Microbiome Project)的参与研究人员,来自哈佛大学的计算生物学家Curtis Huttenhower与他的同事们发现在样品收集后,如果没有冰箱,那么可以加入这种保护剂使用。
不过一些用户也报告了RNAlater的缺陷,虽然RNAlater可以用于样品运输,但是这种保护剂会降低Bacteroidetes和Ruminococcaceae两种细菌新鲜提取后的菌群数量。另外就是如果想获得样品高RNA产量,那么就必须先将其去除。Ganz表示,“RNAlater会妨碍样品正常形成颗粒沉淀,因此在去除RNAlater之后,还必须磷酸盐缓冲液进行清洗。”